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DNA條形碼:讓中藥材鑒定擺脫經(jīng)驗依賴

2021年8月27日

在我國抗擊新冠肺炎疫情的過程中,中醫(yī)藥發(fā)揮了獨特作用。中醫(yī)藥的傳承、創(chuàng)新和發(fā)展對我國醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的發(fā)展具有積極的現(xiàn)實意義。近年來,人工智能、大數(shù)據(jù)等高新科技為傳統(tǒng)中醫(yī)藥的發(fā)展不斷賦能,中醫(yī)藥領(lǐng)域取得了大量的創(chuàng)新成果。為此,本報推出“科技賦能中醫(yī)藥”系列報道,將中醫(yī)藥在診療方法、藥材研發(fā)與鑒定等方面的創(chuàng)新成果一一呈現(xiàn)。

中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)具有通用性,只需選用一個或少數(shù)幾個基因片段即可對絕大部分物種進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定;鑒定過程更加快速;重復(fù)性和穩(wěn)定性高;實驗過程標(biāo)準(zhǔn)、操作簡單;可通過互聯(lián)網(wǎng)和信息平臺對現(xiàn)有物種序列信息進(jìn)行集中統(tǒng)一管理;可有效緩解分類鑒定人才缺乏的現(xiàn)狀。

中藥材造假的現(xiàn)象自古有之。近年來,由于中藥材種類繁多、來源復(fù)雜以及受市場利益的驅(qū)使,中藥材品種混淆、摻偽現(xiàn)象時有發(fā)生,不僅導(dǎo)致中藥材的聲譽受損,而且也對患者的生命安全造成了威脅。以白鮮皮為例,許多患者由于服用了與植物白鮮皮相似的偽品中藥材加工成的飲片,導(dǎo)致藥物性肝損傷。

因此,識別藥材真假偽劣尤為重要。然而,許多混偽品與藥材形態(tài)相似,用傳統(tǒng)的理化鑒定方法區(qū)別較為困難。人們亟待發(fā)現(xiàn)一種能準(zhǔn)確、快速、可靠地鑒定藥材的新方法,在此背景下,中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所所長陳士林研究員帶領(lǐng)科研人員研發(fā)出一種新的中藥材鑒定方法——中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)。

為中藥材量身定做“基因身份證”

中藥材傳統(tǒng)鑒定方法主要包括基原鑒定、性狀鑒定、顯微鑒定和理化鑒定。

這些鑒定方法各有側(cè)重。基原鑒定應(yīng)用植物、動物或礦物的形態(tài)學(xué)和分類學(xué)特征,對中藥材的來源進(jìn)行指認(rèn),因而對所鑒定材料的完整度有較高的要求;性狀鑒定是對藥材宏觀性狀的感官鑒定;而顯微鑒定主要依據(jù)的是藥材微觀構(gòu)造和特征;理化鑒定則是根據(jù)藥材的某些物理性質(zhì)或化學(xué)性質(zhì),采用物理或化學(xué)手段,對其進(jìn)行真?zhèn)舞b別。

“不過,這些方法在一些近緣種、易混種的中藥材鑒定上存在局限。此外,傳統(tǒng)鑒定方法依賴經(jīng)驗,對鑒定人的專業(yè)素質(zhì)要求較高。由于相關(guān)人才培養(yǎng)周期長,很多地方的老藥工已經(jīng)很少,面臨人才斷代的困境!敝袊嗅t(yī)科學(xué)院中藥研究所所長陳士林告訴科技日報記者,中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)很好地解決了這一難題,讓中藥材鑒定不再依賴藥工。

陳士林介紹,DNA條形碼的概念由加拿大動物學(xué)家保羅·赫伯特首次提出,是指使用一段較短的、標(biāo)準(zhǔn)的、易擴增的DNA片段對物種進(jìn)行快速、準(zhǔn)確、標(biāo)準(zhǔn)化的鑒定。而中藥材DNA條形碼主要記錄的是現(xiàn)行分類系統(tǒng)下代表中藥材物種的DNA序列信息。中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)就是適用于中藥材物種鑒定的DNA條形碼,通俗來講,就是為中藥材量身定做的“基因身份證”。中藥材要獲得屬于自己的“基因身份證”,需要利用分子生物學(xué)手段,進(jìn)行DNA提取、PCR擴增和序列測定、序列分析等。

陳士林認(rèn)為,相比傳統(tǒng)的中藥材鑒定方法,中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)具有多方面優(yōu)勢。

“該技術(shù)具有通用性,只需選用一個或少數(shù)幾個基因片段即可對絕大部分物種進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定;鑒定過程更加快速;重復(fù)性和穩(wěn)定性高;實驗過程標(biāo)準(zhǔn)、操作簡單;可通過互聯(lián)網(wǎng)和信息平臺對現(xiàn)有物種序列信息進(jìn)行集中統(tǒng)一管理;可有效緩解分類鑒定人才缺乏的現(xiàn)狀。”陳士林說。

近年來,DNA條形碼鑒定技術(shù)在中藥材鑒定中已得到成功應(yīng)用,擺脫了傳統(tǒng)形態(tài)鑒定方法依賴長期經(jīng)驗的束縛。陳士林強調(diào),該技術(shù)有利于標(biāo)準(zhǔn)化,是中藥分子鑒定方法學(xué)上的創(chuàng)新。

不過,這項鑒定技術(shù)也存在短板。陳士林解釋:“由于DNA條形碼鑒定技術(shù)主要在核酸層面對物種進(jìn)行鑒定,不包含物種的性狀和物理化學(xué)質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)信息。所以,對于在炮制或加工過程中DNA降解的藥材鑒定能力有限。另外,DNA條形碼不能鑒定礦物藥材!

讓中藥材鑒定更趨標(biāo)準(zhǔn)化

近年來,國內(nèi)相關(guān)團(tuán)隊正在推動中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)體系的建立。

比如,陳士林本草基因組學(xué)團(tuán)隊在大樣本量中藥材基因序列篩選研究基礎(chǔ)上,出版了《中國藥典中藥材DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)序列》和《中藥DNA條形碼分子鑒定》,建立了中藥材DNA條形碼分子鑒定體系。

“該體系包括以ITS2+psbA-trnH為主體的植物類藥材DNA條形碼鑒定體系和COI+ITS2的動物類藥材DNA條形碼鑒定體系!标愂苛纸榻B。

2010年,陳士林團(tuán)隊比較了7個候選DNA條形碼,篩選的標(biāo)準(zhǔn)包括PCR擴增效率、種內(nèi)/種間遺傳變異等。通過對7個門753個屬4800個物種6600多個樣品的ITS2序列鑒定能力進(jìn)行分析,顯示ITS2在物種水平的鑒定效率高達(dá)92.7%。

因此,陳士林團(tuán)隊建議將ITS2作為藥用植物標(biāo)準(zhǔn)DNA條形碼,同時建議ITS2可作為新的通用條形碼用于鑒定更廣泛的植物類群。2011年,中國DNA條形碼植物工作組對來自75科141屬1757物種6286樣本的4個DNA條形碼進(jìn)行研究,建議把ITS/ITS2作為種子植物的核心條形碼。

為了保證鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性,陳士林團(tuán)隊還建立了DNA條形碼數(shù)據(jù)庫。DNA條形碼數(shù)據(jù)庫不僅是存儲樣品信息和DNA條形碼序列的工具,而且是DNA條形碼研究和物種鑒定分析的生物信息學(xué)平臺,對推進(jìn)中藥材鑒定方法通用化、標(biāo)準(zhǔn)化和國際化具有重要作用。

在研究基礎(chǔ)上,陳士林團(tuán)隊建立了中藥材DNA條形碼鑒定系統(tǒng),核心數(shù)據(jù)庫涵蓋了《中國藥典》(2010年版,2015年版)收錄的幾乎所有動物、植物藥材及常見混偽品,并包含了《韓國藥典》《日本藥局方》《印度藥典》《歐洲藥典》以及《美國藥典》所記錄的草藥藥材,擴展數(shù)據(jù)庫中涵蓋的物種數(shù)超過十萬種,序列超過百萬條。

助力中藥材產(chǎn)業(yè)發(fā)展

“中藥材DNA條形碼鑒定技術(shù)近年來發(fā)展迅速!标愂苛直硎尽

2019年,陳士林團(tuán)隊與深圳華大智造科技股份有限公司合作開發(fā)了我國具有完全自主知識產(chǎn)權(quán)的首創(chuàng)中草藥基因測序智能鑒定儀——中草藥DNA條形碼高通量基因測序一體機,成功攻克產(chǎn)業(yè)鏈條上游壁壘,完成硬件儀器的自主知識產(chǎn)權(quán)和國產(chǎn)化,讓我國中草藥基因鑒定擺脫了對國外儀器的依賴。

此外,通過將DNA條形碼技術(shù)與等溫DNA擴增技術(shù)、側(cè)向流檢測試紙(LFD)裝置相結(jié)合,陳士林團(tuán)隊還成功研發(fā)出一種快速鑒定劇毒植物鉤吻的方法。

“該方法易于執(zhí)行且不需要專業(yè)設(shè)備,可在30分鐘內(nèi)產(chǎn)生可靠結(jié)果,適用于鉤吻的現(xiàn)場快速鑒定,也為包括植物和動物在內(nèi)的其他物種的快速現(xiàn)場鑒定提供了新的思路。”陳士林說。

隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,高通量測序具有測序讀數(shù)更長、測序深度更深的優(yōu)勢,成為潛在的測序方法。陳士林表示:“我們基于中藥材條形碼數(shù)據(jù)庫和長讀測序技術(shù),提出了全長多條形碼方法,該方法能夠識別多物種混合物的生物起源,詮釋了DNA條形碼技術(shù)在多物種混合物中的應(yīng)用,對于來源復(fù)雜、形狀不明顯,或者已經(jīng)被粉碎的中藥材的鑒定研究,提供了切實可行的方向!

據(jù)介紹,中藥材DNA條形碼已被納入《中國藥典》(2020),為中藥材建立了“基因身份證”,從基因?qū)用娼鉀Q了中草藥與混偽品的物種識別問題,同時也被納入了《英國藥典》,應(yīng)用在中藥的種植、生產(chǎn)、加工、流通及臨床應(yīng)用等多個環(huán)節(jié)。

提及中藥材產(chǎn)業(yè)的發(fā)展,陳士林建議,要以無公害種植為抓手,瞄準(zhǔn)藥材品質(zhì)提升領(lǐng)域關(guān)鍵核心技術(shù),盡快開展中藥材品質(zhì)提升工程戰(zhàn)略,種植、生產(chǎn)安全且優(yōu)質(zhì)的中藥材,從源頭上提升中藥材的質(zhì)量,保障用藥安全,助力中藥材產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。

“中醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展必須依靠科學(xué)和技術(shù),只有掌握原創(chuàng)性的技術(shù)才能更好地助力中藥材產(chǎn)業(yè)發(fā)展!标愂苛謴娬{(diào)。

來源(百家號) 作者(人民資訊)

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