基因測(cè)序攜大數(shù)據(jù)打通上下游
作者:佚名 來源:醫(yī)藥網(wǎng) 2017-7-28 打印內(nèi)容
橫向資源協(xié)調(diào)合作
創(chuàng)新制造以智能化為典型特征,要求中國(guó)醫(yī)藥企業(yè)以新技術(shù)提升運(yùn)營(yíng)效率。精準(zhǔn)醫(yī)療是未來醫(yī)療行業(yè)的發(fā)展趨勢(shì),而精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展必須依托大數(shù)據(jù)平臺(tái),因?yàn)槠脚_(tái)運(yùn)營(yíng)與數(shù)據(jù)服務(wù)是生物醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要環(huán)節(jié),基礎(chǔ)設(shè)施供應(yīng)商合作并采用聯(lián)合運(yùn)營(yíng)的方式,才能為醫(yī)療機(jī)構(gòu)、測(cè)序企業(yè)等數(shù)據(jù)提供方企業(yè)提供產(chǎn)業(yè)支持保障。
值得關(guān)注的是,從生命大數(shù)據(jù)提供方企業(yè)的角度,包括華大基因、諾禾致源、金域檢驗(yàn)、藥明康德、達(dá)安基因等,數(shù)據(jù)都需要“存、管、算、察”的強(qiáng)大核心功能支撐,以實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)空間分布式存儲(chǔ)應(yīng)用,解決存儲(chǔ)空間和數(shù)據(jù)持久化、數(shù)據(jù)解耦、分級(jí)部署、數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)、動(dòng)態(tài)重組、信息分析調(diào)度、跨集群分布式計(jì)算等復(fù)雜性問題。
隨著人類基因組測(cè)序成本以“超摩爾定律”速度下降,與之相匹配的基因組數(shù)據(jù)分析成本也在下降,尤其是在2016年至今,短短一年,基因數(shù)據(jù)分析成本的下降速度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過了基因測(cè)序成本下降的速度,F(xiàn)在,單個(gè)人的全基因組數(shù)據(jù)分析成本已經(jīng)降低至100元人民幣以內(nèi)。
基因大數(shù)據(jù)分析包括十幾個(gè)步驟,如果每個(gè)企業(yè)做數(shù)據(jù)分析面對(duì)不同的步驟選擇差異化方法,如何來組織不同的工具更優(yōu)地高效分配計(jì)算任務(wù),這是目前整個(gè)基因測(cè)序、云計(jì)算、器械設(shè)備研發(fā)等軟硬件企業(yè)都在致力于優(yōu)化的戰(zhàn)略性工作。北京聚道科技(GeneDock)有限公司CEO李夏戎指出,不僅需要每個(gè)企業(yè)聚焦自身的底層數(shù)據(jù)優(yōu)化,還需要產(chǎn)業(yè)鏈橫向跨步驟協(xié)同!鞍℅ATK算法優(yōu)化,加速計(jì)算運(yùn)轉(zhuǎn)過程,減少CPU開銷,并且同產(chǎn)業(yè)鏈合作伙伴一同將技術(shù)封裝,制定數(shù)據(jù)壓縮、存儲(chǔ)方案;基因測(cè)序公司也需要將數(shù)據(jù)調(diào)整成分布式,從而協(xié)同開發(fā)更加易用的操作流程!
華大基因CEO尹燁表示,檢測(cè)成本下降,如今已不是單個(gè)公司憑技術(shù)挖掘就可以解決的,“從上游醫(yī)療器械設(shè)備廠商,到中游基因測(cè)序企業(yè),再到下游健康服務(wù)平臺(tái),基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)基于生命大數(shù)據(jù)各環(huán)必須共有、共為、共享;全行業(yè)預(yù)計(jì)到2020年能夠?qū)蝹(gè)人的全基因組測(cè)序和分析總費(fèi)用控制在2000元人民幣以內(nèi),數(shù)據(jù)分析流程標(biāo)準(zhǔn)化和費(fèi)用快速下降,將有望提前實(shí)現(xiàn)行業(yè)預(yù)期!
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